會計專業碩士注重會計專業能力的培養和提升，并培養學員的領導能力和職業素養，課程實用性較高，下文介紹該專業的課程設置。

核心基礎課

該專業的核心基礎課有：管理經濟學、財務會計理論與實務、財務管理理論與實務、管理會計理論與實務、審計理論與實務、管理信息系統、商業倫理與會計職業道德、政治課、外國語。核心基礎課是學員必須修讀和完成的課程內容，占25學分。

方向必修課

該專業的方向必修課有：國際會計準則專題、政府與非盈利性組織會計、數量分析方法、金融市場與金融工具、市場營銷管理、企業并購、技術經濟與管理、投資學、風險管理、中國稅制、公共財政與國有資產管理、戰略管理和經濟法、財務報表分析、經濟責任審計、稅務會計等。方向必修課不同院校，不同專業方向的具體修讀課程不同，一般需要修夠14學分。

選修課

選修課由學生根據個人興趣及自己的專業方向，在院校的研究生課程中自行選修，含方向必修課中未修讀過的課程，一般需要修夠6學分。