河南醫藥大學于2003年藥學本科專業開始招生，2004年成立藥學院。設有藥理學、藥劑學、藥物化學、藥物分析學、中藥學、臨床藥學6個教研室，1個實驗教學中心、1個藥物研究所。現有藥學、藥物制劑、臨床藥學3個本科專業；擁有藥學一級學科碩士學位授權點、專業碩士學位授權點；現有本科在校生797人、碩士研究生127人。獲批河南省首批研究生教育創新培養基地建設單位，系河南省執業藥師繼續教育培訓基地。

學院現有教職工89人，其中專任教師72人（男42人，女50人；副教授以上34人，教授10人；博士57人，占79.2%。）教師分別來自于中國藥科大學、沈陽藥科大學、復旦大學等20余所著名高校。另外，還聘請10名國內外知名專家為特聘兼職教授。教師中有國家食品藥品監督管理局化妝品評審專家1人，全國優秀教師2人；河南省優秀專家1人，河南省新藥審評專家1人，河南省特聘教授3人，河南省高層次人才“中原千人計劃”1人，中原科技創新領軍人才1人，河南省高校科技創新人才2人，河南省青年骨干教師6人，河南省教育廳學術技術帶頭人7人；河南省教學名師1人，河南省教學標兵3人，新鄉醫學院教學名師5人，太行學者1人，太行青年學者4人；碩士研究生導師33人；留學歸國博士8人，形成了一支愛崗敬業，教書育人，治學嚴謹，為人師表的高素質教師隊伍。

學院始終堅持教學工作中心地位，專業建設和教學質量工程建設穩步推進，教育教學水平不斷提高。藥學專業為國家級特色專業、河南省一流本科專業、河南省高等學校“專業綜合改革試點”，藥學專業教學團隊為省級優秀教學團隊，藥學實驗教學中心為河南省高校實驗教學示范中心。《藥理學》、《天然藥物化學》為省級精品課程，《臨床藥理學》為省級雙語教學示范課程，《天然藥物化學》為河南省一流本科課程、河南省高校精品在線開放課程，《有機化合物波譜分析》為河南省研究生教育優質課程。

學院高度重視學科建設和科研工作。藥學學科為河南省一級重點學科；擁有“河南省天然藥物研究”院士工作站；先后獲批河南省高校科技創新團隊、新鄉市科技創新團隊；建有河南省心血管重構與藥物干預國際聯合實驗室，3個新鄉市重點實驗室；擁有包括400兆超導核磁等教學科研儀器設備1000余臺（件）。2014年以來，獲得各級科研課題60余項，其中國家級項目27項，發表 SCI論文130余篇，獲得國家發明專利授權40項。學院被評為學校科研工作先進集體。

學院始終堅持立德樹人，大力推進素質教育，切實提高人才培養質量。積極開展大學生第二課堂和社會實踐活動，著力加強學生創新精神和實踐能力的培養，努力提高學生的綜合素質，人才培養質量穩步提升。2014年以來，本科生獲得國家級大創項目25項,校級科研課題37項，獲校挑戰杯二等獎1項、三等獎1項。以研究生為第一作者發表SCI論文14篇。根據畢業生跟蹤調查反饋，用人單位滿意度達99%，社會認可度較高。本科學生就業率達96%以上，考研率達30%以上；研究生就業率達100%。學院多次被評為學校“三育人”工作先進集體。

學院注重對外交流與合作，廣交朋友，共謀發展，與國內外多個高校、科研院所和醫藥企業建立了良好的協作關系，為學院的發展創造了有利條件。