機械電子工程學院前身為林業機械系，1958年招收第一屆“林業機械設計與制造”專業本科生，1960年9月正式建系。1994年1月成立機械工程學院，1997年7月更名為機械電子工程學院。

　　學院現有教職工119人，其中教授25人，副教授39人，國家教學名師1人，國務院特殊津貼1人，林業部和江蘇省有突出貢獻的中青年專家各1人，江蘇省高校科研創新團隊和“青藍工程”優秀教學團隊各1個，江蘇省“333工程”、“六大人才高峰”、“青藍工程”等培養對象26人。近5年獲國家科技進步二等獎、國家教學成果二等獎各1項，教育部科技進步二等獎2項，承擔了國家重點研發計劃、國家自然基金等國家、省部級課題60余項，累計科研經費5000多萬元，發表SCI、EI收錄論文200余篇，授權發明專利近100件。

　　學院現有機械設計制造及其自動化、機械電子工程、自動化、測控技術與儀器、機器人工程、智能制造工程等6個本科專業，其中機械設計制造及其自動化、機械電子工程、自動化為國家一流本科專業建設點，機器人工程、智能制造工程為新工科專業，目前在校本科生2000余人。

　　學院現有“機械工程”一級學科博士點(2011年）、“機械工程”博士后流動站（2012年）、“控制科學與工程”一級學科碩士點、“動力工程與工程熱物理”一級學科碩士點（化工過程機械方向）、機械（含機械工程和控制工程2個領域）專業學位碩士點。其中，“機械工程”為“十四五”江蘇省重點學科，“機械設計及理論”為國家林業局重點（培育）學科。目前在校研究生400多人。

　　學院下設林業機械系、機械制造工程系、自動化系、過程裝備與控制工程系、測控技術系、機械電子工程系、工程圖學教研室、力學教研室，建有現代林業技術裝備國家級虛擬仿真實驗教學中心和5個省級工程中心及虛擬仿真共享平臺，與20余家企業合作建立了研究生工作站和實踐示范基地，建有機械基礎、機械工程、自動化與測控技術等3個實驗教學中心和1個面向大學生創新的機電創新綜合訓練中心。實驗室總面積6700多平方米，儀器設備價值約2000多萬元，教學科研設備先進、設施完善，為學生科研和創新實踐提供了有力保障。

　　學院與美國、德國、加拿大、澳大利亞、瑞典、韓國等國外大學和機構建立了長久的合作關系，聯合開設的優本生國際交流項目受到學生的一致好評，取得了顯著成效。成功舉辦了中德研討會、IEEE機器人與人等影響力顯著的國際會議，拓寬了學生的國際視野。

　　學院經過60多年的發展，逐步形成了林業機械及其智能化、機電一體化與檢測、流體機械與密封、數字化設計與先進制造、測控技術與智能系統等穩定的研究方向，特色鮮明，在林業機械裝備行業具有明顯優勢和較強的競爭力。