化學(xué)與分子工程學(xué)院的前身是南京化工學(xué)院于1983年正式建立的應(yīng)用化學(xué)系，由基礎(chǔ)課部的四大化學(xué)教研組和腐蝕與防護(hù)專業(yè)教研組（招收腐蝕與防護(hù)專業(yè)，1974年）發(fā)展而來，1985年設(shè)置生物化工、工業(yè)分析專業(yè)，1989年設(shè)置應(yīng)用化學(xué)專業(yè)，2002年設(shè)置化學(xué)專業(yè)（化工學(xué)院），2000年與數(shù)學(xué)教研組、物理教研組合并成立理學(xué)院。2015年4月由理學(xué)院的應(yīng)用化學(xué)系和化學(xué)化工學(xué)院的化學(xué)專業(yè)合并組建化學(xué)與分子工程學(xué)院。

學(xué)院下設(shè)化學(xué)系、應(yīng)用化學(xué)系、化學(xué)教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心等教學(xué)單位，以及先進(jìn)化學(xué)制造研究院（IAS）、水處理技術(shù)研究所、應(yīng)用化學(xué)研究所、氟化學(xué)應(yīng)用技術(shù)研究所、化學(xué)生物學(xué)與功能分子研究所等科研機(jī)構(gòu)。

學(xué)院擁有化學(xué)博士后科研流動(dòng)站（2023年）、化學(xué)一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)（2021年）、材料與化工專業(yè)博士點(diǎn)（2021年）、應(yīng)用化學(xué)二級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)（2001年），化學(xué)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)（2006年），應(yīng)用化學(xué)（1981年）、有機(jī)化學(xué)（2003年）、分析化學(xué)（2006年）等3個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)，材料與化工（2019年）二級(jí)學(xué)科專業(yè)碩士點(diǎn)，以及化學(xué)（2002年）、應(yīng)用化學(xué)（1989年）等2個(gè)本科專業(yè)。化學(xué)學(xué)科獲批“十四五”江蘇省重點(diǎn)學(xué)科。化學(xué)專業(yè)為國(guó)家一流本科專業(yè)（2020年），應(yīng)用化學(xué)專業(yè)入選省級(jí)一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)（2022年）。學(xué)院牽頭的“化學(xué)拔尖學(xué)生培養(yǎng)基地”為省級(jí)基礎(chǔ)學(xué)科拔尖學(xué)生培養(yǎng)計(jì)劃2.0基地建設(shè)點(diǎn)。在2022“軟科中國(guó)大學(xué)專業(yè)排名”中，“應(yīng)用化學(xué)”和“化學(xué)”兩個(gè)專業(yè)分別獲評(píng)A、B+等級(jí)，分列全國(guó)第38、58名。學(xué)院支撐建設(shè)的化學(xué)學(xué)科繼續(xù)保持在ESI全球排名前1‰（2021年1月首次進(jìn)入ESI全球排名前1‰，排名世界第121位。2024年11月上升至0.031%，全球排名第63位，全國(guó)第27位，江蘇省第3位）。

學(xué)院擁有國(guó)家實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心分中心、省級(jí)化學(xué)基礎(chǔ)課實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室智能醫(yī)用傳感材料與器件、石油和化工行業(yè)水處理化學(xué)品工程研究中心、江蘇省水化學(xué)與工業(yè)水處理工程研究中心等國(guó)家和省部級(jí)科研平臺(tái)，也是江蘇省農(nóng)用化學(xué)化工專業(yè)委員會(huì)和江蘇省水化學(xué)水處理專業(yè)委員會(huì)的掛靠單位。

學(xué)院現(xiàn)有教職工138人，外籍全職教師2人，其中專職教師106人，正高40人，專職教師博士化率98.15%，具有海外經(jīng)歷占比72.64%。擁有國(guó)家級(jí)人才4人次，江蘇特聘教授3名，江蘇“外專百人計(jì)劃”1名，江蘇“雙創(chuàng)人才”2名，江蘇“雙創(chuàng)博士”17名，全國(guó)化工優(yōu)秀科技工作者1名，江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”二層次1名、三層次2名，江蘇省“青藍(lán)工程”中青年學(xué)術(shù)帶頭人3名、省杰青1人，省優(yōu)青4人，省“六大人才高峰”高層次人才5人，南京市有突出貢獻(xiàn)的中青年專家1名。2016年成立的先進(jìn)化學(xué)制造研究院（IAS），匯集了來自美國(guó)哈佛大學(xué)、耶魯大學(xué)、賓夕法尼亞大學(xué)、芝加哥大學(xué)、西北大學(xué)、紐約大學(xué)、德國(guó)慕尼黑大學(xué)、西班牙加泰羅尼亞化學(xué)研究所等世界一流大學(xué)的杰出學(xué)者。

學(xué)院以教學(xué)工作為中心，承擔(dān)全校基礎(chǔ)化學(xué)教學(xué)工作，加強(qiáng)師資隊(duì)伍建設(shè)，不斷提高教學(xué)工作水平。近年來，先后涌現(xiàn)出《無機(jī)與分析化學(xué)》等一批省級(jí)精品課程。指導(dǎo)省級(jí)重點(diǎn)（國(guó)家級(jí)）“大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)與實(shí)踐開放基金”項(xiàng)目數(shù)十項(xiàng)，主編《分析化學(xué)》、《無機(jī)與分析化學(xué)》、《物理化學(xué)》、《有機(jī)化學(xué)》、《有機(jī)化學(xué)微型試驗(yàn)》、《化學(xué)類專業(yè)實(shí)驗(yàn)（雙語(yǔ)版）》等教材十余部。獲得全國(guó)高校教學(xué)微課大賽、全國(guó)“互聯(lián)網(wǎng)+”大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽、省高校青年教師教學(xué)競(jìng)賽、省高校微課教學(xué)比賽、省教學(xué)研究成果獎(jiǎng)以及省優(yōu)秀畢業(yè)論文等獎(jiǎng)項(xiàng)20余項(xiàng)，發(fā)表教學(xué)改革論文100余篇。

學(xué)院先后承擔(dān)國(guó)家重大專項(xiàng)課題、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家“863”計(jì)劃課題、國(guó)家科技支撐項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、省部級(jí)課題200余項(xiàng)，橫向科研項(xiàng)目700余項(xiàng)，年均科研經(jīng)費(fèi)超過1000萬(wàn)元。獲得國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、省部級(jí)獎(jiǎng)10余項(xiàng)，獲得國(guó)內(nèi)外授權(quán)專利150余件。近五年來，在國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表SCI論文1000余篇，其中Science、Nature子刊、JACS、Angew. Chem. Int. Ed.、Adv. Mater.等高水平論文600余篇。

學(xué)院作為江蘇省首批黨建工作標(biāo)桿院系培育創(chuàng)建單位、學(xué)校首批“三全育人”綜合改革示范學(xué)院，始終堅(jiān)持立德樹人根本任務(wù)，貫徹“愛與服務(wù)”學(xué)生工作理念，落實(shí)“五育并舉”，努力探索創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，著力培養(yǎng)擔(dān)當(dāng)民族復(fù)興大任的時(shí)代新人。目前，全院在校生1427人，其中本科生922人、博士研究生43人、碩士研究生462人。近年來，本科生畢業(yè)班考研率達(dá)35%、就業(yè)率達(dá)96%，先后有140余名應(yīng)屆畢業(yè)生赴清華大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院、University of Arizona、University of Copenhagen、National University of Singapore等海內(nèi)外知名高校和科研機(jī)構(gòu)深造；共有4篇研究生論文被評(píng)為江蘇省優(yōu)秀碩士、博士論文，23個(gè)項(xiàng)目獲得江蘇省研究生創(chuàng)新資金的資助，與日本神戶大學(xué)、新加坡南洋理工大學(xué)、美國(guó)波士頓學(xué)院、韓國(guó)成均館大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)12名研究生；120余人次獲得省級(jí)以上學(xué)科競(jìng)賽獎(jiǎng)勵(lì)。學(xué)院連續(xù)舉辦20余年的“中丹創(chuàng)新杯”實(shí)驗(yàn)技能大賽以及新近創(chuàng)立的江蘇省普通高等學(xué)校大學(xué)生“安萊立思”杯水處理實(shí)驗(yàn)創(chuàng)新大賽、“普析杯”儀器測(cè)試大賽，已成為在省內(nèi)具有較大影響力的大學(xué)生科技活動(dòng)品牌。

展望未來，學(xué)院將堅(jiān)持以習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想為指導(dǎo)，堅(jiān)持立德樹人根本任務(wù)，聚焦一流化學(xué)學(xué)科建設(shè)，固本強(qiáng)基，內(nèi)涵發(fā)展，力爭(zhēng)建設(shè)國(guó)際知名的高水平創(chuàng)業(yè)型化學(xué)學(xué)院。